Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TwistnbQ78WZ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwistnbQ78WZ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwistnbQ78WZ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms