Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3eapQ76KJ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3eapQ76KJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms