Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2r2Q6ZWZ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2r2Q6ZWZ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms