Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms