Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Casc1Q6TDU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casc1Q6TDU8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms