Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn2Q6PHP6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrn2Q6PHP6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrn2Q6PHP6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms