Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1cQ6PDZ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms