Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3bQ6PDC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc3bQ6PDC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc3bQ6PDC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc3bQ6PDC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms