Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx19Q6P4T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx19Q6P4T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms