Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac10Q6P3E7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac10Q6P3E7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms