Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r2aQ6P1F6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r2aQ6P1F6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2aQ6P1F6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms