Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wdr44Q6NVE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr44Q6NVE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms