Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms