Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp1Q6K1E7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms