Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt87Q6IMF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt87Q6IMF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt87Q6IMF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt87Q6IMF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms