Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgap20Q6IFT4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap20Q6IFT4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms