Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddx11Q6AXC6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx11Q6AXC6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms