Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Atg9aQ68FE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg9aQ68FE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms