Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Aebp1Q640N1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Aebp1Q640N1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Aebp1Q640N1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Aebp1Q640N1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms