Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfe3Q64092 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tfe3Q64092 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfe3Q64092 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfe3Q64092 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfe3Q64092 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfe3Q64092 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfe3Q64092 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms