Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic3Q62521 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic3Q62521 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zic3Q62521 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms