Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Npm1Q61937 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm1Q61937 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm1Q61937 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms