Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33bQ61897 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms