Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd1Q61466 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcd1Q61466 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcd1Q61466 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms