Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpf4bQ61136 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf4bQ61136 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms