Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinQ61043 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinQ61043 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinQ61043 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinQ61043 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinQ61043 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinQ61043 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinQ61043 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinQ61043 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NinQ61043 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NinQ61043 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NinQ61043 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinQ61043 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinQ61043 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinQ61043 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NinQ61043 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinQ61043 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinQ61043 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinQ61043 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinQ61043 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinQ61043 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinQ61043 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NinQ61043 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinQ61043 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinQ61043 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinQ61043 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinQ61043 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinQ61043 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinQ61043 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NinQ61043 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NinQ61043 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NinQ61043 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinQ61043 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinQ61043 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinQ61043 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinQ61043 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinQ61043 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinQ61043 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinQ61043 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinQ61043 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinQ61043 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinQ61043 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinQ61043 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinQ61043 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NinQ61043 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NinQ61043 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinQ61043 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NinQ61043 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinQ61043 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinQ61043 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NinQ61043 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinQ61043 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinQ61043 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinQ61043 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinQ61043 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinQ61043 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinQ61043 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinQ61043 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinQ61043 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinQ61043 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinQ61043 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinQ61043 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinQ61043 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinQ61043 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinQ61043 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinQ61043 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinQ61043 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinQ61043 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms