Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd6Q61003 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd6Q61003 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd6Q61003 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd6Q61003 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd6Q61003 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd6Q61003 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd6Q61003 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms