Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sin3aQ60520 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sin3aQ60520 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms