Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5bQ60519 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema5bQ60519 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema5bQ60519 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms