Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1Q5SXY1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1Q5SXY1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1Q5SXY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms