Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc92bQ5SUE3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc92bQ5SUE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms