Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1810065E05RikQ5NC41 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1810065E05RikQ5NC41 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1810065E05RikQ5NC41 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms