Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcnt3Q5JCT0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt3Q5JCT0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcnt3Q5JCT0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms