Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdh1bQ5F204 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mdh1bQ5F204 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mdh1bQ5F204 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.7 ms