Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afap1l2Q5DTU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Afap1l2Q5DTU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afap1l2Q5DTU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms