Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
WhammQ571B6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WhammQ571B6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WhammQ571B6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
WhammQ571B6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms