Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2cd3Q52KB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2cd3Q52KB6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2cd3Q52KB6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2cd3Q52KB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms