Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm4Q4VBF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm4Q4VBF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms