Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xirp2Q4U4S6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xirp2Q4U4S6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xirp2Q4U4S6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Xirp2Q4U4S6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Xirp2Q4U4S6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp2Q4U4S6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp2Q4U4S6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.8 ms