Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam228bQ497Q6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam228bQ497Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms