Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc110Q3V125 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc110Q3V125 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms