Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC051142Q3V0M8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms