Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
4930567H17RikQ3V0K5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
4930567H17RikQ3V0K5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
4930567H17RikQ3V0K5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms