Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garnl3Q3V0G7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garnl3Q3V0G7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Garnl3Q3V0G7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms