Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm6Q3UZD5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Prdm6Q3UZD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Prdm6Q3UZD5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm6Q3UZD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Prdm6Q3UZD5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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