Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkain3Q3URJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkain3Q3URJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain3Q3URJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms