Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Q3UPC7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q3UPC7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q3UPC7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q3UPC7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q3UPC7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q3UPC7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q3UPC7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Q3UPC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q3UPC7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q3UPC7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q3UPC7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q3UPC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q3UPC7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q3UPC7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Q3UPC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Q3UPC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Q3UPC7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q3UPC7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q3UPC7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q3UPC7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q3UPC7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3UPC7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3UPC7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3UPC7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3UPC7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3UPC7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms