Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc33Q3ULW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc33Q3ULW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms