Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uspl1Q3ULM6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uspl1Q3ULM6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uspl1Q3ULM6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms