Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdhd2Q3UGR5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdhd2Q3UGR5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdhd2Q3UGR5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hdhd2Q3UGR5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms